La medicació no s'ha d'interrompre sense la supervisió d'un professional. Els antidepressius no es poden deixar de manera brusca, perquè poden aparèixer símptomes de retirada (ansietat, diarrea, somnis vívids).
Com tots els medicaments, els antidepressius poden tenir efectes adversos, que depenen del mecanisme d'acció de cada fàrmac i que solen millorar conforme avança el tractament.